FACSAria III具有卓越的分析性能，极高灵敏度，与最新技术水平的分析型仪器的性能等同。它运用了与BD FACSCanto™ II和BD LSRFortessa™相同的光胶耦合流动池设计和稳定性光路结构。这种设计的光学结构可以达到高数值孔径光学收集。流动池和喷嘴的设计能够使颗粒在分析区域降低流速以便收集最多光信号，之后颗粒在通过喷嘴后在液流中加速，从而进行高性能细胞分选。由于BD FACSAria III光学和液流系统的精密设计，与传统的空气激发系统在相同的分析和分选速度时进行比较BD FACSAria III有更杰出光学检测灵敏度。